F/A-18战斗攻击机装两台通用电气公司研制的F404-GE-400低涵道比涡轮风扇发动机，单台加力推力7200千克，发动机重量为983千克，推重比7.4，进气道采用固定斜板设计，位于翼根下的机身两侧。飞机内部可带4990千克燃油，还可挂三个副油箱，飞机总载油量可达7979千克。头部右侧上方还装有可收藏的空中加油管。F404是低旁通比涡扇，旁通比0.34，该发动机具有三级钛合金风扇，一排固定进气导向叶片和一排可变导向叶片，七级压气机，前三级为可变叶片定子，最后是单级高低压涡轮。F404发动机结构简单，活动部件相对较少。该发动机在高迎角状态下有很好的压缩机失速特性，即使偶尔失速也能通过发动机和加力燃烧室再次点火迅速自行恢复。发动机响应迅速，从怠速到全加力状态只需4秒。
F/A-18战斗攻击机安装了4余度数字线传飞控系统，是首个安装这种系统的生产型飞机。飞控计算机根据操纵杆和脚蹬输入的数据来控制各个操纵面的偏转量，不允许飞行员飞出超出限制的动作。线传系统采用投票制运行，如果其中一个通道与其他三个通道输出不同，那么该通道就会被判定为失效，并被自动关闭。4余度线传系统在即使两个通道都失效时，只要剩余两个通道输出一致，仍可以继续控制飞机，即使所有通道都失效，仍可通过电动备份系统操纵各翼面。该型的平尾甚至还保留了一路机械操纵备份，在最为极端的情况下，飞行员可继续进行俯仰操纵。
外挂弹药
F/A-18战斗攻击机外部能携带13700磅弹药，共有9个外挂架，两个翼尖挂架各可挂1枚AIM-9L空空导弹；两个外翼挂架可带空对地或空对空武器，包括AIM-7“麻雀”空空导弹、AIM-9空空导弹、AIM-120空空导弹、AGM-84反舰导弹，AGM-65空地导弹和AGM-88A导弹；两个内翼挂架可带副油箱或空对地武器；位于发动机短舱下的两个挂架可带“麻雀”导弹或马丁·马丽埃塔公司的AN/ASQ-173激光跟踪器、攻击效果照相机和AN/AAS-38前视红外探测系统吊舱等；位于机身中心线的挂架可技副油箱或武器。
