F/A-18安装了Itek公司的AN/ALR-67雷达告警接收装置，可对各种电子威胁进行探测、分析、分类并采取对抗措施。飞行员可在座舱显示器上看到这些威胁的信息和方位，然后采用诸如投放箔条和红外诱饵弹这类的主动对抗措施。机背上有两个刀片天线，前一个是柯林斯AN/ARN-118塔康天线，后一个是UHF通讯天线。此外还安装有两台AYK-14数字计算机以及利顿公司的惯性导航系统，两台凯撒公司的多功能显示器和费伦第/本迪克斯公司的中心屏幕显示与乎视显示器等。
雷达
1977年末，休斯公司的AN/APG-65数字多模脉冲多普勒雷达在与威斯汀豪斯公司的竞争中获胜，被选为F/A-18的雷达。APG-65工作在I/J波段（8-12.5GHz），内置可识别和隔离故障的测试设备（BITE）。雷达和武器投放系统共有20多个机载计算机，与雷达相连的计算机负责将机载传感器产生的数据转换成容易理解的信息显示给飞行员，同时这些计算机对投放武器时所需的弹道、偏差、速度和高度等数据进行快速计算，并在HUD和CRT显示器上向飞行员显示相关信息。
火控系统
F/A-18的武器控制系统包括攻击显示分系统、数据处理分系统、参数测量（传感器）分系统和外挂物管理/控制分系统等4个主要部分。
