弹舱
第五代战斗机追求隐身性能，所以必须尽可能减少飞机外表面各种突起，而外挂的武器弹药和副油箱就是外表面最强烈的反射源。所以第四代战斗机设计上，都将常用的武器置入机身弹舱内，弹舱也成为了整个机体设计的难点，其增大了机身内部体积造成空重的大幅度上升，同时还使得机身变宽变厚加大阻力。
歼-31的机身，相对F-22和歼-20来说较为瘦削和单薄，在发动机直径相差不大的情况下其弹仓高度和宽度都必然较小；同时由于起落架收入机身侧面，其也无法像F-35一样利用进气道侧面空间布置大型弹舱只能和F-22和歼-20一样在机身下部布置弹舱。
从其机身厚度分析，如果采用类似F-22和歼-20的同时具有乱序发射-高G机动发射-大迎角发射-高速发射能力的大型弹射挂架，其较薄的机身只能安装如米卡（MICA）类似大小的较小体型空对空导弹，如果采用类似F-35的较为简单的挂架设计，则可以携带如PL-12这样的标准尺寸空对空导弹。
当然这主要是针对雷达制导中距离空对空导弹，小巧的红外制导近距离格斗导弹需要在发射前就锁定目标，因此在F-22和歼-20上设计了复杂笨重的侧弹舱，可以在高速机动状态下将导弹伸出机体外，用红外导引头捕捉目标然后发射，由于该机机身侧面被起落架舱占据，同时机身长度也不如歼-20那样可以在安装起落架舱后仍然有空间布置格斗弹舱，因此该机应该没有携带格斗弹的弹舱。由于较小的腹部弹舱，该机基本不可能拥有类似F-35这样携带重型炸弹的能力，从这个角度来看该型飞机还是一种典型的制空用战斗机。
油箱
常规战斗机外挂武器和副油箱是最严重的附加反射源，因此第四代战斗机设计中非常重视减少副油箱的使用，在普通作战任务中尽可能完全依靠机内燃油完成，这与第四代战斗机严重依赖副油箱的情况完全不同。
