航运专家指出，倘若“停靠费”落地实施，其影响将迅速传导至中美贸易主航线上，严重扰乱两国之间的货物运输与物流秩序。中国对美出口产品多为适合集装箱运输的日用消费品、电子产品、纺织品等，其利润本已不高，新增成本可能迫使出口商放弃美国市场，直接威胁到中美贸易的稳定性。

反过来，美国消费者也难以独善其身。如果中国船只减少对美航次，或者航运成本大幅上升，美国将面临产品短缺、物流延迟、物价上涨的多重压力，通胀势必进一步加剧。

美国港务局协会（AAPA）警告称，拟征费用将引发港口拥堵、运营成本飙升，并波及相关产业。首当其冲的是美国的港口运营商、运输企业、小型航运公司和进出口商。航运协会负责人甚至直言：“这是一场惩罚自己人的贸易政策。”

目前，美国本土航运业及农业、制造业等高度依赖海运物流。据估算，美国班轮运输直接和间接创造就业岗位超过640万个；农业和食品行业则提供了约2300万个岗位，占全国总就业的15%。一旦出口成本飙升，可能迫使农业州减产、制造业缩减运力，重创“铁锈地带”产业工人。

美国石油协会也发声反对，称此举将削弱美国能源出口竞争力，尤其是液化天然气（LNG）领域。波罗的海国际航运公会表示，目前全球用于LNG运输的船舶绝大多数为中国建造，美国国内不仅没有相关技术基础，连一艘LNG船的在建订单都没有。

面对这一极具争议的提案，多国政府及航运企业密集发声。法国达飞海运财务官表示：“从亚洲到北美的运输，是全球贸易命脉。任何单边措施都会给全球运输行业带来震荡。”彭博社援引圭亚那总统的话称，加征费用将损害整个加勒比地区的能源出口利益。