在弹劾危机之外，尹锡悦还因涉嫌内乱罪而受到多部门联合调查。据指控，尹锡悦曾下令戒严部队进入国会，并试图逮捕在野党政治人士，其行为涉嫌试图瘫痪国会职能。根据韩国法律，若以破坏宪政秩序为目的策划暴动，即构成内乱罪，主犯可被判无期徒刑甚至死刑。

针对这一指控，尹锡悦的律师团队已明确表示不予承认，但将积极配合相关调查。他们同时指出，当前弹劾案和内乱罪调查交织在一起，耗费大量精力，希望调查部门能够进行协调以减少干扰。

韩国媒体分析称，弹劾案的听证进程和内乱罪调查可能深度交织，互相影响。尤其是内乱罪指控的定性和调查结果，或将直接左右宪法法院对弹劾案的最终裁决。

目前，针对尹锡悦的内乱罪调查由韩国检察机关和“共同调查本部”双轨并行进行。“共同调查本部”由韩国警察厅、高级公职人员犯罪调查处以及国防部联合设立，旨在避免重复侦查造成的低效。然而，由于调查权限模糊，外界担忧可能出现“投机选择调查机构”的情况。

法律界人士分析，尹锡悦作为检察官出身，可能更倾向于配合检察机关的调查，以此争取更为有利的调查方向。但如果他拒不配合，无论是检方还是调查本部，均可能申请逮捕令甚至采取强制措施。

目前，检方已多次向尹锡悦发出传唤，但均遭拒绝。警方也试图对总统府进行扣押搜查，却因总统警卫处的阻拦未能进入核心区域，仅获取了部分自愿提交的材料。

随着宪法法院听证会日期临近，弹劾案、内乱罪调查和宪法法官任命之争交织，韩国政坛正面临空前的动荡局面。

外界普遍认为，弹劾案最终裁决最早可能在明年2至3月作出，但这一进程充满变数。执政党和在野党围绕宪法法官任命问题的争执可能进一步延缓审理时间，而内乱罪调查的结果亦可能直接影响总统的弹劾命运。

韩国宪法法院此前曾在朴槿惠弹劾案中扮演关键角色，但本次涉及总统的弹劾审理和刑事指控双线展开，其复杂程度远超以往。无论最终结果如何，这场司法与政治的博弈都将对韩国政局和宪法秩序产生深远影响。