中山陵是中国国父孙中山先生的陵墓，被视为中华民族的重要象征之一。马英九拜谒中山陵的原因，主要有以下几个方面的深层次分析：

1、推动两岸关系的和谐发展：马英九在任期内，致力于推动两岸关系的和谐发展。拜谒中山陵可以被视为他推动两岸关系的和平发展的一个象征性举动。

2、回归中华文化的根源：中山陵作为中华民族的重要象征之一，代表了中华文化的深厚底蕴和历史渊源。马英九拜谒中山陵，也可以被视为他回归中华文化根源的一种表达。

3、传承孙中山先生的遗志：孙中山先生是中国近现代史上的杰出人物，他为中国的民主革命和国家独立事业做出了杰出的贡献。马英九拜谒中山陵，也可以被视为他传承孙中山先生的遗志，继承他的民族精神和爱国情怀。

4、加强两岸人民的交流和往来：马英九拜谒中山陵，也可以被视为他希望加强两岸人民的交流和往来的一种表达。两岸关系的发展不仅仅是政治上的，更是文化、经济和人文层面上的交流与融合。通过拜谒中山陵这种文化活动，可以增强两岸人民之间的感情和互信，促进两岸的和平发展。

所以，马英九拜谒中山陵既包括他个人的政治意图，也体现了他对中华文化和民族精神的认同，同时也是为了推动两岸关系的和平发展。(责任编辑：杨靖)