几名幸存者在接受采访时描述，飞机在飞到车臣首府格罗兹尼附近时遇到了麻烦。飞机机身似乎遭到撞击，还听到了奇怪声响。乘务员阿萨多夫回忆说，自己感到了三次尝试降落在格罗兹尼。乘务员拉希姆利听到两声巨响，有爆炸物碎片穿透机舱。一位幸存乘客也提到，在飞机第三次试图降落在格罗兹尼时，出现了巨响声，部分外壳受损。

根据泄漏的通信记录显示，机长克什尼亚金曾多次报告称“自己失去了对飞机的控制”，飞机液压系统和GPS系统均无法正常工作。他认为造成这一现象的原因可能是“鸟群撞击飞机”。

幸存乘客苏洪库尔·拉希莫夫称，自己也听到了巨响声，看到飞机机体受损后以为飞机马上就要坠毁，但飞机竟然奇迹般地继续飞行。另一名幸存乘客瓦法·沙巴诺娃则回忆说，在飞机坠毁前看到飞机在海上，以为要掉进海里，但飞机还在往前飞。

航空专家分析称，两名飞行员驾驶着已经受损的飞机飞过了里海，并在距离阿克套机场仅3公里外的地面上迫降。

对于飞机坠毁可能与俄罗斯有关的说法，俄总统新闻秘书佩斯科夫表示，在对阿塞拜疆航空公司客机坠毁原因调查结束之前进行假设是错误的。相关调查正在进行，在得出结论之前提出任何假设都是错误的。