基地内数百工作人员，还依机密等级不同穿上3种不同颜色工作服，手机的拍照功能也被限制。

因其保密程度爆棚，被形容为“台湾版51区”，与预防医学研究所、核能研究所并称台湾三大神秘机构。

启用至今，“中科院”在九鹏基地相继完成“雄风”“天剑”“天弓”等导弹的研发自制、发射任务，也曾试射采购的“爱国者”“响尾蛇”等导弹。

但在台湾岛上，不管多重要的机构，都逃不过意外事故。

这次发生事故的拌、铸药厂房2022年6月才启用，当时“中科院”院长张忠诚还在启用仪式上提醒工作人员提高自我安全意识，务必将工安做到滴水不漏。

没想到竟成了一口保质期一年的毒奶。

还有早在2022年7月，在进行火药销毁作业时也曾发生爆炸并窜出大量黑烟，引起附近居民恐慌。

后来才被披露，是“逾期火药销毁”作业，由于天气因素和较高的湿度，这才有烟尘四散的情况。

离基地最近的满州乡九棚村、牡丹乡乡旭海村和高士村有大约千户居民，九鹏基地军事演训和导弹试射不断，居民不堪其扰，纷纷抱怨“每天都砰砰叫，窗户跟屋顶一直裂开”。