中东海域此前很少同时出现两艘美国航母。2月底，美以发起对伊朗的联合打击时，“福特”号和“林肯”号都位于中东。4月，“布什”号被派去接替“福特”号后，该地区的航母数量一度增至三艘。每艘航母约有5000名舰员，护航舰艇还要再增加约1000人。这意味着，在巅峰时期，需要保障的人员规模达到1.8万人。

早在战争爆发之初，伊朗导弹和无人机就击中了美国第五舰队在巴林的后勤总部，重创了地区供应链的核心枢纽。科威特和阿联酋等美国海军长期依赖的补给节点也相继遭袭。美方找到的最近替代枢纽，是英国控制的迪戈加西亚岛，位于3500公里外的印度洋中部。

起初，英国时任首相斯塔默禁止美国飞机和军舰把迪戈加西亚岛作为攻击伊朗的基地使用。后来在特朗普施压下，斯塔默允许美方出于“防御”目的使用该岛，实际上主要用作补给。迪戈加西亚岛位于大多数伊朗导弹射程之外，却也远离美国舰艇，显著拉长了补给链。据前海军官员估算，补给船如今需要航行三倍以上的距离才能取回物资，补给频率可能从3天一次降至10天一次。

一些“林肯”号的士兵表示，战争初期，由于供应链断裂，舰上被迫经历一段配给时期。有一段时间，他们的餐食只有金枪鱼罐头拌面，或者玉米热狗，许多人因此明显消瘦。7月初停靠阿曼补给后，情况大为好转，食物供应充足，但年轻士兵每顿饭仍可能要排队等上一个小时。

除了“好好吃饭”成为问题，舰上的卫生条件同样不容乐观。《军事时报》和《星条旗报》等媒体报道说，舰上出现了马桶堵塞、淋浴间发霉、生活用水污染、空调和洗衣设施故障等问题。一名士兵告诉CNN记者布朗，有时可能只是站在队伍里等饭，或者刚洗完澡出来，天花板上霉斑处的水渍就会滴到脸上。