1999年5月9日，菲律宾破船“马德雷山号”以“船底漏水需要维修”为由非法“坐滩”到了中国仁爱礁西北侧的礁盘上。至今该船已经在中国仁爱礁停留超过9000天，菲律宾一直拒绝将其拖走。然而，现在这艘船的状态已经非常糟糕，几乎不可能再被拖走了。

在“马德雷山号”非法“坐滩”后，中国对菲律宾的行为表达了强烈谴责，并敦促其将船拖走。但菲律宾无视了中方声明，意图通过这艘破船强占中国仁爱礁。面对这种行为，中国采取了反制措施，阻止菲方向船上运送修复加固材料。不过，基于人道主义考虑，中国允许菲方提供食物和饮用水等生存物资。

由于长期无法得到修复，“马德雷山号”的状况越来越差，几近解体。2023年，菲律宾试图借助美国的帮助向“马德雷山号”运送补给。例如，当年11月21日开始，美菲联合在中国南海进行了为期三天的“海空巡逻”，这是自2016年以来首次重启此类军事行动。尽管有美方支持，菲律宾仍然未能成功运补。

2024年，“马德雷山号”的一组近照显示，其舰艇中部出现了一个长达6米多、宽几十厘米的大裂缝，其他地方尤其是靠近海面的部分也出现了多个大小不一的破洞。如果继续保持现状，不久后“马德雷山号”将面临海水倒灌，加速锈蚀并最终解体。届时，菲律宾要拖走这艘破船将面临重大技术风险。

此外，仁爱礁海域存在大片珊瑚，因“马德雷山号”的存在，珊瑚群覆盖面积大幅下降。一旦船体四分五裂，如何在不伤害珊瑚的情况下清理废铁成为一大难题。而且，从政治角度看，菲律宾也无法轻易拖走这艘船。因为“马德雷山号”的非法“坐滩”是菲律宾向美国表示忠诚的一种方式，拖走它会破坏美菲之间的政治合作。同时，菲律宾在仁爱礁问题上的立场也使其与中国及东盟国家的关系恶化。因此，菲律宾只能继续让“马德雷山号”非法“坐滩”。

可以说，自从菲律宾借仁爱礁问题介入中美竞争后，它就已经失去了自主选择权。