克什米尔领土争议是深层结构性矛盾的核心。1947年分治后，克什米尔地区王公的归属选择引发第一次印巴战争，联合国275号决议要求公投至今未能实施。目前，印度控制约45%（查谟、克什米尔邦及拉达克），巴基斯坦控制约35%（阿扎德克什米尔和吉尔吉特-巴尔蒂斯坦），剩余20%在中国控制（阿克赛钦、喀喇昆仑走廊），形成本区域多边纠纷。印度2019年废除宪法第370条，将查谟-克什米尔邦重组为联邦直辖区，单方面改变现状的举动引发巴方强烈反弹。双方的军事战术导致擦枪走火成为常态。印度陆军奉行“冷启动”原则，意在快速、有限纵深地打击巴军关键节点并在国际干预前迫使对方让步。巴基斯坦则以“全域威慑”回应，依托战术核武器与常规火力，使印度难以确保快速决战，形成“不对称—核安全困境”。

国内政治与民族主义也是重要因素。在印度，强硬对巴立场常被政党用作动员民族主义、巩固票仓的手段；2019年普尔瓦马事件后莫迪政府便借空袭巴方境内目标强化“反恐铁腕”形象。在巴基斯坦，军方与情报机构在国家政治中地位特殊。面对外部压力，军方以“保卫克什米尔”来维护自身权威、转移国内经济与治理难题。“穆罕默德军”等跨境武装组织的活动呈现新特征：袭击目标从军警扩展至平民定居点，2022年印度国家调查局记录显示，针对克什米尔潘迪特移民社区的袭击同比激增240%。这些组织利用加密通讯和暗网筹资，形成跨国网络，使得主权国家更难完全控制冲突烈度。

大国博弈也影响着印巴关系。美国一度把巴基斯坦视为反恐盟友，却因阿富汗与印度关系的变化而摇摆不定；东大与巴关系密切，但亦希望避免失控。国际社会的“调停惯例”使得印巴双方都相信，一旦冲突升级，外部力量会迫使对方停火，降低了动武门槛。