当地时间4月16日，美国国土安全部长克丽丝蒂·诺姆宣布取消向哈佛大学提供的两项总额超过270万美元的拨款。此前，美国联邦政府以冻结联邦经费为要挟，要求多所高校进行整改，哈佛大学则选择拒绝。

哈佛大学在4月14日明确表示，不会接受特朗普政府提出的对其管理结构、招聘及招生政策进行大幅改革的要求。作为回应，美国政府随即宣布冻结该校总额约22.6亿美元的联邦经费。15日，特朗普进一步威胁要取消哈佛大学的免税资格，并要求该校道歉。

面对特朗普政府的压力，哈佛大学校长艾伦·加伯在致哈佛社区成员的一封信中写道，政府提出的要求已经超出联邦政府权限，哈佛大学不会接受其此前提出的要求。几小时后，美国政府宣布冻结哈佛大学的巨额多年期拨款和合同款项。如果哈佛继续抗命，正接受审查的另外60多亿美元联邦经费也可能面临危险。

特朗普在社交媒体上发文，威胁剥夺哈佛大学的免税地位，应视作“政治实体”征税。白宫新闻秘书卡罗琳·莱维特表示，特朗普认为哈佛大学应为其纵容校内的“反犹”行为向犹太裔美国学生道歉。她还对哈佛大学获得联邦经费的前景表达了怀疑。