与调查人员对峙警卫为韩陆军警备团。韩国警察厅国家调查本部紧急戒严特别调查团于1月3日透露，为了执行对尹锡悦的逮捕令，共派出30名公调处调查官和120名警察。当天上午8时04分左右，调查官和警察步行通过了总统官邸前设置的路障，随后通过了总统警卫处设置的公交车车墙，并与负责官邸警备的陆军防卫司令部55警备团发生了对峙。在结束与警备团的对峙后，调查官试图进入总统官邸建筑，但再次与总统警卫处发生对峙。他们向警卫处长出示了逮捕令并请求协助，但警卫处长以《警卫法》和“警卫区域”为由表示不允许搜查。

3日上午，韩国公调处进入位于首尔龙山区汉南洞的总统官邸，开始执行对被停职的总统尹锡悦的逮捕令。据报道，当地时间8时02分许，约35名公调处调查官进入总统官邸正门，8时04分许开始执行逮捕令。公调处调查官当天凌晨从政府果川办公大楼出发，分乘5辆车前往总统官邸。抵达官邸后，他们遭遇尹锡悦支持者和总统警卫处的阻拦，一度未能进入。

2024年12月31日，韩国首尔西部地方法院以涉嫌发动内乱和滥用职权为由对尹锡悦发布逮捕令。这是韩国宪政史上首次对现任总统发出逮捕令。