鉴于飞行员在发出紧急信号时称遭到鸟撞，最初人们认为，这起空难是鸟撞导致发动机出现故障，进而让飞机失去动力，从而出现机腹着陆的情况。但《卫报》报道，多位航天专家指出，在鸟撞机事件频发的现在，鸟撞可能并不是造成这起灾难的唯一原因。“即便鸟撞能让一台发动机系统失灵，飞行员也完全可以依靠另一台发动机。”澳大利亚中央昆士兰大学拥有丰富飞行经验的道格·德鲁里教授称，自己不太相信鸟撞是造成这起空难的唯一原因。澳大利亚新南威尔士大学航空设计高级讲师索尼娅·布朗博士也认为，现代飞机设计中其实有考虑到这个因素。即便是在特殊情况下飞机一台发动机失去动力，这架飞机仍有足够的动力。“这款飞机上有不止一套独立的液压系统，一般来说，鸟不可能同时摧毁所有液压系统。”布朗称，这起事故有些令人“匪夷所思”。

“我最困惑的是，飞机在接近跑道时的速度为什么会那么快。”德鲁里称，一般情况下，如果飞行员已经决定要用机腹着地的方式降落，会尽力让飞机减速，“但这架飞机似乎并没有减速的迹象。” 德鲁里补充称，飞机最终的降落方向也与该跑道平常的降落方向相反，“飞机通常会逆风降落以减速，但失事飞机最终可能是顺风降落。” 还有航空专家指出，让飞机减速的关键手段有三种：依靠起落架、依靠发动机反推装置以及机翼两侧的襟翼。一般情况下，飞机降落时襟翼被翻起以增加阻力，并且把机翼压向地面增加机轮与地面的摩擦力。失事飞机着陆时，飞行员似乎无法控制发动机和起落架。看了现场视频的专家们认为，失事飞机似乎也没有启动襟翼。

除了飞机本身的问题，跑道的长度以及尽头的那堵墙也是外界争议的焦点。事发时务安机场原本长9200英尺（2804米）的跑道因施工，只有8200英尺（2499米）可用。不过，韩国官员称这一长度足够波音737-800型号飞机降落。有英国航空安全领域专家表示，韩国机场当局应承担严肃责任，这起事故中与跑道尽头墙壁的碰撞是此次灾难的“决定性瞬间”。黄浩源也认为，如果没有这堵墙，而是将天线安装在诸如杆子一样的载体上，可能会避免悲剧的发生。但包括黄浩源在内的多名航空专家同时强调，在撞上那堵墙之前，飞机就已经出现了明显问题。据路透社报道，绝大多数韩国机场都是按照国际标准建造的，但韩国国内法律允许在“不显著影响机场设施性能”的范围内调整某些设施的位置。美国前飞行员道格·莫斯在接受《华盛顿邮报》采访时指出，这个机场的设计有问题，“我们应该预料到飞机可能冲出跑道。” 针对“务安机场跑道尽头混凝土构造导致客机爆炸”的质疑，韩国国土交通部航空政策室室长朱锺浣在记者会上表示，该混凝土设施符合相关设置规定。