在台湾潜艇研发制造期间，黄曙光以郭玺为“顾问”，后者自称看中的是他的人脉，他负责联系各国与潜艇相关的设备以及人员的引进。郭玺后来说，因为各国依照规定不能供应台湾敏感军事设备，所以他的工作其实非常偷偷摸摸，见不得光。

岛内为首艘潜艇研发制造编列了近500亿新台币的预算，2020年10月，台立法机构预算中心发布预算评估报告指出，该潜艇筹建计划累积编列预算已达277亿，占总经费的56.29%，但需采购的81项主装备中仍有34项未获输出许可，且海军方面给出的说法反复，称是因为审查的民代们感到该案存在风险，于是提议冻结了一部分预算，也因此导致黄曙光一度被调查。需要指出的是，提案冻结本来是正常的民代审议职责，提出动议的有国民党也有民进党，但经过媒体炒作，变成了批在野党阻扰。

简而言之，岛内潜艇研发经费巨大，而经费使用过于不透明，形成了很多争议点：比如向成立仅仅几十天的设备公司采购重要组件——这一切似曾相识，让人联想到这些年民进党当局向小吃店采购防疫设备，委托“一人公司”进口鸡蛋等故事。所以真正的问题并不在马文君身为民代的监督责任，而是郭玺这些人在其中到底扮演了什么角色。

岛内现任防务负责人邱国正说郭玺确实做过一段时间顾问，但因为这个人有问题，所以只做了一年。邱国正还称马文君没有泄密问题。

马文君（资料图）

马文君的说法则是，因为某天收到有人提供的3000笔资料和录音，其中包括郭玺、台船董事长郑文隆、海昌厂柳姓厂长等，其中关键点是郭玺希望让韩籍的池姓顾问开公司，但池不愿当郭玺员工，想要自己开公司。结果郭玺和对方闹翻，池顾问之后就把这几年跟郭玺有关的录音全部放出来，其中还涉及郭请韩国人谎称制造水上舰的方式来台湾帮忙做水下舰，而这些已经违背了韩国的法律。实际上，这些韩国人有可能向台湾泄露的机密中，不仅包括韩国潜艇机密，还涉及到韩国用到的相当多德国潜艇专利，这已经是非常复杂的国际争议。