第四，先进可靠的制导体制。在制导体制上，“红旗”-16FE相比“红旗”-16A/B有了脱胎换骨的变化。根据介绍，该导弹采用捷联自主初制导+修正指令中制导+间断照射半主动/主动双模雷达寻的末制导。通俗地讲，在导弹发射之初，采用捷联惯导模式，捷联惯导的优势是它是一种不依赖其他平台的自主制导模式，抗干扰能力强。缺点是在飞行过程中，误差会逐渐积累扩大，所以在拦截弹飞行中段，由上文中提到的跟踪制导雷达通过数据链向弹上上载指令，完成目标位置信息和诸元参数的修正和装定，对其误差进行指令修正，使得拦截弹得以精确飞向目标拦截区域。此时，“红旗”-16FE拦截弹上的主动制导雷达开机，并对目标进行扫描跟踪，引导拦截弹精确拦截目标。此时，用于照射的地面火控雷达，则可以在需要的时候，对目标进行间断而非持续性照射，通过主被动雷达一起努力，精确命中目标。早先的“红旗”-16A/B采用半主动雷达末制导，末制导完全依赖照射雷达照射导引，较容易被电子干扰影响，而“红旗”-16FE使用复合末制导，不单独依赖雷达半主动制导和主动雷达制导，且半主动雷达采用更安全的“间断”照射模式，这样一来抗干扰能力大大提升，跟踪目标稳定性大幅提升，命中率显著提升。目前世界上先进的第四代防空导弹，都在谋求采用复合制导技术，譬如ESSM“增程型海麻雀”，就打算在未来采用红外+主动雷达复合末制导模式。而“红旗”-16FE率先使用双模复合末制导，一下子将自己的制导技术水平推向了世界领先行列，成为“红旗”-16FE跃居世界领先防空导弹行列的重要助力因素之一。

“红旗”-16FE导弹发射车