塔利班与“基地”组织的关系是否已完成切割同样存在巨大的不确定性，而外界多认为塔利班并未与“基地”组织进行彻底切割。美国撤军后，“基地”组织头目扎瓦希里曾再次宣布效忠塔利班。而2022年7月底扎瓦希里在塔利班控制的喀布尔市区被美国无人机击毙，更使外界确信“基地”组织依然和塔利班存在密切联系。新加坡南洋理工大学拉惹勒南国际研究院研究员阿卜杜勒·巴西特（Abdul Basit）分析指出，美国的暗杀行动使塔利班在两条战线上都陷入了困境：“一方面，它可能导致塔利班失去华盛顿仅剩的信任，并使其在短期内获得国际承认的机会化为泡影。因为人们发现协助组织‘9·11’袭击的‘基地’组织首领被允许居住在喀布尔。另一方面，这次暗杀很可能使塔利班与‘基地’组织的关系严重受损且无法修复。在扎瓦希里被杀之前，两个组织之间的关系是建立在信任的基础上的。”

固守意识形态底线，社会管理保守落后

塔利班依然无法放弃伊斯兰主义意识形态，社会管理封闭保守，阿富汗民众、特别是妇女权利无法得到保障。

塔利班的温和化主要表现为放弃其过去曾经表现出的极端主义的一面（如炸毁巴米扬大佛、频繁发动暴力恐怖袭击、施行残酷的伊斯兰刑罚等极端做法），但塔利班并未放弃其伊斯兰主义的意识形态底线，其基本宗旨是反对西方化、反对世俗化，主张返回伊斯兰教的原初教旨、变革现存世界秩序、推翻现存世俗政权，建立由宗教领袖或教法学者统治的以伊斯兰教法为基础的伊斯兰国家和秩序。

在1996—2001年的塔利班政权统治时期，阿富汗全面推行所谓的“伊斯兰化政策”。在宗教上严格遵循一神论，反对多神论和偶像崇拜；在政治上建立实施伊斯兰教法的伊斯兰政体。在社会文化领域，塔利班宣布取消各种文化和娱乐活动；男子必须留胡子，妇女出门要戴面纱、穿大袍；妇女不仅没有选举权和被选举权，更被取消参加工作和接受教育的权利。在法律领域，塔利班以严刑峻法处治违反伊斯兰教法者。在宗教生活中，塔利班极力贯彻一整套刻板的清规戒律，强调遵循宗教教条，反对一切形式的科学技术及世俗文化和教育。