为了摧毁现有思想，实现控制对方精神的目的，中情局无所不用其极。药物的使用被认为是实现精神控制的有效手段。在这其中，无色无味无嗅但药效惊人的致幻剂LSD无疑成了主要角色。《卫报》报道称，戈特利布想要知道，一个人最多能服用多大剂量的LSD，会不会最终突破极限值让这个人的精神完全被摧毁？中情局曾向精神病人、囚犯、妓女、吸毒者提供LSD，因为他们是“无法反抗的人”，《纽约时报》还记录了一名肯塔基州的精神病人连续服用LSD长达174天的案例。

此外，实验也瞄准了不知情的普通人。根据一份1977年美国参议院听证会的文件，中情局用自己的安全屋开了几家“妓院”，对被引诱来的人下药，他们在屋内安装了双面镜和微型话筒，方便观察对方行为、获得情报以及满足自己的好奇心。并且，为了探索LSD对不同类型人群的效果，中情局还在正常环境中偷偷地对不知情、非自愿的对象使用LSD，例如将LSD混入酒水、香烟，而且实验对象涵盖各个层面。事实上，就连中情局的员工也成了实验对象。据《卫报》报道，弗兰克·奥尔森，一名对自己工作感到不安的中情局科学家，被戈特利布偷偷下药，数日后在酒店坠亡。然而，这些危险的实验并没有给中情局带来什么有价值的数据，LSD的效果被认为是“不可控的”。

除了LSD以外，中情局也尝试了其他药物，包括海洛因、吗啡、麦司卡林等。金泽尔告诉NPR，在二战中，德国纳粹曾在其三大中心集中营之一的达豪集中营对致幻剂麦司卡林进行过实验，中情局便聘请纳粹医生来进行指导，探索这种药物对精神控制的作用。中情局还邀请纳粹医生前往美国德特里克堡，教授中情局官员沙林毒气的相关知识，他们想要了解沙林毒气将人置于死地要花多久。金泽尔表示，“MKUltra本质上是日本和纳粹集中营工作的延续。”