进入21世纪后，日本防卫省认为88式岸舰导弹已经无法满足新的作战环境，提出了12式岸舰导弹的研制计划，最大射程增加180千米-220千米。根据作战环境的变化，陆上自卫队除了要求12式岸舰导弹增加射程之外，还要求提高导弹的命中精度和战场生存能力。外形上，12式导弹和88式导弹相似，使用三菱重工集团生产的一台TJM2型涡喷发动机和一个固体火箭助推器为主要动力。为了提高命中精度和抗干扰能力，12式岸舰导弹采用惯导+GPS+地形匹配制导+末端主动雷达制导的复合制导方式，具备攻击小型水面目标能力，并且还具备一定的对地攻击能力，可以打击陆地纵深较浅的地面目标，比如海军港口、空军基地等。

近年来，陆上自卫队一边换装新的12式岸舰导弹，另一方面根据战略需求调整岸舰导弹的部署。去年3月，日本自卫队在大分县汤布院新成立了一支岸舰导弹部队，番号为第8岸对舰导弹连队，配备射程约200公里的12式岸舰导弹。这是继在冲绳组建第7岸舰导弹连队后，日本自卫队在西南方向军事部署上又一个重要举动。驻汤布院的第8地对舰导弹连队将与冲绳、熊本、青森和北海道的多支岸舰导弹部队，共同组成了遍布日本列岛的“导弹链”，控制不少具有重要战略意义的海峡和航道。

需要指出的是，陆上自卫队有3个岸舰导弹联队部署于九州和冲绳，控制对马海峡、大隅海峡以及冲绳周边水道等由黄海、东海进出西太平洋的重要海上通道。而且面对西南方向的3个联队主要装备更为先进的12式反舰导弹，可见陆自对西南方向的重视。比如第7地对舰导弹联队驻冲绳胜连分屯地，隶属西部方面队第2特科团，下辖4个中队，装备12式岸舰导弹。其中两个中队部署在冲绳和宫古岛，导弹打击范围覆盖宫古海峡。以宫古岛第5岸舰导弹连队302中队为例，主要装备是2部搜索雷达车，1辆指挥车，1辆通信车，1辆火控车；发射车4辆（每车备弹6枚），一次可发射24枚导弹；弹药运输车1-4辆，每车备弹6枚。总人数为60人。