CPT原子钟的出现，不仅在军事领域，还对其他学科发展起到推动作用。如大地测量专业、水文专业等，往往要求定位精度达5毫米，采用CPT原子钟可满足这一要求。
值得一提的是，目前由我国自主研制、生产的原子钟已达世界先进水平。据中国航天科工集团公司网站消息，该公司下属研究所是国内唯一一所同时具备铷原子钟、铯原子钟和氢原子钟研制能力的单位，已经为北斗全球导航系统提供了大量高性能原子钟。
GPS(全球卫星导航系统)是一种利用时间差为用户提供定位服务的系统，其关键设备是原子钟。打个比方，卫星上的原子钟在某时间发出信号，地面用户在另一时间接收到该信号，那么，从卫星到地面用户的距离是时间差乘以光速。理论上，只要地面用户同时接收到3颗卫星发出的信号，就能测算出自己的精确位置，实现定位和导航。由于地面用户不使用原子钟，这一测算结果存在3米误差。
近年来，随着GPS的军事应用越来越广，用户对GPS定位精度的要求越来越高，达到厘米级。如何使原子钟实现小型化甚至微型化，使其可搭载在导弹等武器装备上，成为新的研究课题。
CPT原子钟的出现，为解决这一问题提供了方案。CPT原子钟体积仅有半个火柴盒大小，且稳定度高，可将原来的3米误差缩小至1米以下。
