岛内大罢免蓝营虽取得胜利，但因死亡连署案导致的“抄家”仍在继续。目前已有12个县市党部遭到搜查，超过百名党工被约谈，其中有6人仍被羁押，包括台北市党部主委黄吕锦茹、嘉义县党部书记长杨富程、国民党组发会副主委黄碧云等干部。国民党表示将全力营救这些人员，以防止县市党部组织逐渐瓦解。

为对抗民进党发起的大罢免行动，国民党主席朱立伦曾提出“以罢制罢”的策略，但由于罢免绿营民代的连署书中出现多件死亡连署，国民党遭到了大规模的司法调查。台南地检署于3月20日率先发起搜查行动，随后台“中选会”在4月1日向“高检署”告发19件罢免案存在伪造或死亡连署，“检察总长”邢泰钊指示将这些案件分发给有管辖权的11个地检署，此后开始了大规模搜查。

截至目前，累计12个县市的国民党县市党部被搜查，共138名党工被约谈，其中6人至今仍被羁押禁见，包括黄吕锦茹、书记长初文卿、总干事姚富文；嘉义县党部书记长杨富程以及中央党部组发会副主委黄碧云和党工谢友光。朱立伦已下达指令，要求国民党律师团提供必要的法律协助，并发动反制司法战，要求国民党团与党中央一起告发不法连署行为，但至今未见明显进展。

蓝营台北市民代王鸿薇宣布罢免失败后，谈及被羁押中的台北市党部主委黄吕锦茹时，她伤心哽咽落泪，认为非常惋惜，无法与黄吕锦茹一同庆祝胜利。尽管反罢成功，国民党仍面临严峻的司法挑战，党内认为未来需谨慎处理，以免影响2026年的“九合一”选举及2028年的“大选”。