除了利用细菌屠杀中国人民外,“波第8604部队”还秘密从事细菌研究、各种传染病研究及鼠疫培养和病体解剖工作。据“波第8604部队”成员井上睦雄证词,他曾随部队进驻原中山大学医学院,被分配到第四课病理解剖班。第四课有病理解剖班、昆虫班、疟疾班。昆虫班主要从事鼠疫跳蚤的培养,疟疾班从事马、猪、鸡的霍乱研究。
华南师范大学学者、华南抗战历史研究中心研究员吴佩军表示,通过名册可以厘清“波第8604部队”的人员构成、机构设置和编制规模等基本史实,也可以通过分析和对照其他日军细菌战部队名簿,梳理“波第8604部队”和731部队、新加坡9420部队等部队之间的内外关联和战时关系,进而厘清日军细菌战体系的构成特点,对全面揭示日军罪行具有重要意义。