针对最新说法，阿塞拜疆政府尚未置评。俄总统新闻秘书佩斯科夫表示，在调查结束之前进行任何假设都是错误的。哈萨克斯坦方面也强调，事故原因仍不明，需要通过调查才能得出结论。

对于“鸟击说”，一些航空专家和军事观察人士提出质疑。德国航空专家海因里希·格罗斯邦加特表示，如果鸟群撞上引擎，可能会导致引擎失灵，但飞机仍然可以控制。然而，飞行轨迹数据和客机影像资料显示，飞机的电气和液压系统已经受损，导致飞机无法控制。哈萨克斯坦航空专家塞里克·穆赫蒂巴耶夫认为，考虑到飞机当时所处的高度，鸟击导致飞机坠毁几乎不可能，更有可能是受到外部撞击。航空分析师理查德·阿布拉菲亚表示，飞鸟撞击通常会导致飞机向最近的机场寻求迫降，但不会偏离航线。

客机为何偏航飞越里海，被认为是此次空难中的一大疑点。巴库与格罗兹尼相距约485公里，飞行约30分钟即可抵达。但客机在途中偏离预定航线数百英里，最终在位于格罗佐尼以东约420公里的里海沿岸城市阿克套近郊坠毁。公开飞行数据显示，飞机在到达里海上空后，飞行轨迹变得诡异，先是向北，然后突然90度转弯，飞向哈萨克斯坦方向。飞机在到达阿克套机场前做“8字形”盘旋动作，随后进入俯冲状态，以机头朝下、向右转弯的姿态撞地。数据显示，飞机的GPS导航系统在海上飞行时全程受到干扰。

先前有说法称，由于格罗兹尼大雾，飞机改变航线。哈萨克斯坦交通部长卡拉巴耶夫表示，哈萨克斯坦控制中心在飞机坠毁前约45分钟收到俄罗斯发出的信号，称航班正在改道。俄罗斯调度员表示，飞机的控制系统出现故障，机组人员在收到恶劣天气报告后决定飞往阿克套。还有说法称，客机试图在格罗兹尼附近机场迫降，但遭俄方拒绝。多名阿塞拜疆政府官员透露，飞机飞到格罗兹尼附近时被俄防空系统击中，随后试图紧急降落，却遭俄拒绝在其附近三个机场降落，并被命令飞越里海，最终在哈萨克斯坦坠毁。