后来随着冷战的结束，一些前华约中东欧国家相继加入北约，使北约与俄罗斯之间在常规武器方面的平衡被打破，北约在常规力量对比方面占有明显优势。1995年俄罗斯以条约“不符合俄罗斯的国家安全利益”为由，要求西方国家同意修改条约的有关条文，否则俄将“被迫退出条约”。为缓解俄罗斯的安全担忧，1999年11月第六次欧安组织首脑会议通过了《欧洲常规武装力量条约修改协议》，并有30个国家签署。《修改协议》用国家限额和领土限额机制取代1990年CFE所规定的集团限额机制，对每个缔约国常规武器装备的国家限额和领土限额（即部署在每个缔约国领土上的本国和外国武器装备的总和）都做出了明确规定。根据《修改协议》，当时的北约19国（即原北约16国加波、捷、匈三国）将大量裁减其常规武器装备数量。

北约举行陆上军事演习

修改后的CFE继承了之前防止使用常规武器发动大规模进攻和突然袭击的宗旨，进而将军事集团之间的武装水平限制转变成国家间的和义务，防止欧洲任何国家在未与其他缔约国协商的情况下，扩充条约限制的军备和集中部署兵力、兵器的可能性，整个常规军备控制体系更加合理和“透明”。但截至2007年，只有俄罗斯、白俄罗斯、哈萨克斯坦和乌克兰四国先后批准了《修改协议》。北约国家以俄罗斯没有履行其削减侧翼地区武器装备的承诺和俄继续在摩尔多瓦、格鲁吉亚驻军为由拒绝批约，这最终导致莫斯科在2007年中断执行该条约，也让该条约基本上名存实亡。

俄罗斯与西方博弈的牺牲品

此次俄正式退出CFE的行为，可谓是近年来俄罗斯与西方关系持续走低的必然结果。