为保护佳山基地，台军于花莲、寿丰及崇德一带建立导弹基地，并有完整的指挥管制、通信和情报系统，以及弹药库、油料库及小型医院等战备设施。除主体工程外，还有一条长约2500米的跑道从附近的花莲空军机场直通山洞机库。执行任务的战机一接到出击命令，重达8吨的铁门便会在60秒内打开，让战机迅速进入跑道升空。

从空中俯看花莲空军基地。佳山空军基地就位于远处的山中。

台湾媒体报道称，佳山基地以中央山脉为屏障，与海边的花莲空军基地、海军军港互为倚靠，加上附近建有多个大型储油库，已成为台湾东部的军事防卫要塞。它对于台湾空军的作用，除了可提供西部战机降落，同时可随时支援澎湖与金门，保卫台北、基隆。

台军还多次进行演习，模拟“花莲港遭到解放军袭击”，然后是台军集结陆军和空军各种先进武器，击退“解放军”。

台军大胜自然只是他们的臆想，但至少显示出他们没有忽视对花莲的防守。

现在台军面临的问题是，在两岸军力差距越来越大的情况下，解放军的能力、手段越来越多，台军即使没有忽视，又能如何？花莲固然出现在解放军的视野之中，其他军事目标同样如此。