按照之前巴基斯坦公布的概念图，这种轻型护卫舰装备的是16联装“红旗-16”垂直发射系统。“该防空系统射程约42公里，可以拦截高度在15米到1.8万米的各种飞行目标，其改进型射程更是增加到70公里。”报道称，考虑到巴基斯坦海军引进的中国产054AP型护卫舰同样装备这种防空导弹，从简化后勤维护角度考虑，新建造的MILGEM型护卫舰选择“红旗-16”也顺理成章。

“信天翁NG”选择的增程版通用防空模块化导弹（CAMM-ER）

但巴基斯坦最终选择了欧洲导弹集团（MBDA）的“信天翁NG”舰空导弹系统。这是一种在“阿斯拉姆”先进短程空对空导弹的基础上，几经改进而来的中程防空导弹系统，最大特点就是小巧。它选择的CAMM-ER导弹最大射程超过40公里，但长度为4.2米、全重160公斤、弹径仅有190毫米，在MK41垂直发射系统中可以轻易地布置“一坑四弹”，也可以见缝插针地安装在轻型舰艇上，的确比“红旗-16”小得多。

THE WEEK网站认为，除了体积因素外，采用半主动雷达制导的“红旗-16”更容易受到对方电子战干扰，而“信天翁NG”选择了主动雷达制导头并加装有双向数据链，“它在发射后几乎不需要依靠舰载雷达引导，使军舰能同时应对更多空中目标”。