台军近年在屏东九鹏基地与周围地区，集中陆海空军大量试射导弹，因“睦邻经费”使用问题，引发地方不满。继失去九鹏北侧的牡丹乡三射坪使用权后，南侧目前用于实施“天马”“神弓”等近程反装甲、防空导弹操演的牡丹乡也传出抗议声，台军方明年恐失去所有实施短程导弹对海射击的训练场。

据台湾联合新闻网3日报道，台军睦邻经费只能用于公益支出与设施改善，提供给乡镇公所自行分配，比如“陆军司令部”提供牡丹乡睦邻经费每年约600万元新台币。然而对比其他部门，如台“中科院”也提供约600万元、“太空中心”提供的回馈经费地方可以自行灵活运用，这也导致“中科院”和“太空中心”能用牡丹乡三射坪训练场、台“国防部”不能用。

屏东县牡丹乡乡民代表潘呈清称，台陆军八军团2021年将旭海村海岸的三射坪训练场，让给“太空中心”做短期科研火箭发射场，而未依法开部落咨询会，违反相关法律，当地原住民部落要求修改“睦邻工作要点”并扬言抵制军演，军方仍坚持不修法，去年才移到南侧满州乡港仔海岸。“回馈金不能满足居民生活需要、休渔损失、健保费补助，每年600万元睦邻金不如不要，军方不要来。”

自上世纪60年代起，台三军联训基地与九鹏导弹基地陆续落户恒春半岛，当地居民难忍长期噪音和爆震，台“国防部”2005年起依“地方睦邻工作要点”，给予半岛东西部受影响乡镇每年各1000万元新台币的睦邻回馈金。“工作要点”称，对位于台军主要武器训练场、实弹射击危险影响区域及油料库、弹药库以及弹药库营区外烧爆毁场所，依实弹射击及遂行油料、弹药勤务造成人民生活影响程度，酌予捐助睦邻经费，借以改善其相关生活设施，促进地方发展。

尽管如此，多年来台军和当地民众仍是冲突不断。据台湾《联合报》报道，今年10月新竹市空军基地战机起降带来的发动机噪音很大，根据“军用机场噪音防治补偿经费分配使用办法”，第一级噪音日夜音量60-65分贝补偿2万元新台币，第二级65-75分贝补偿2.5万元，第三级75分贝以上补偿3万元。但居民抱怨每年补助预算有限，且十多年下来，第二级包括旧港里等多个里都还在等补助。“立委”郑正钤称，新竹市共有近5万户位于噪音防治区，截至去年年底还有近4万户等待补偿。今年台“国防部”的补助预算是6355万元新台币，规划执行补偿2067户，“按今年标准来看，还要19年才能把剩下3万多户补偿发完，居民不满‘飞机吵了一辈子，补偿等了一辈子’”。

2017年9月，位于屏东县车城乡的三军联训基地因长年演习，对当地居民造成噪音、震动、房屋龟裂及尘土等困扰。由于台军方的睦邻经费只能用在公共用途，如修路、铺设水沟等，当地居民认为欠缺对个体实质补助，未能实际填补训练基地带来的困扰。于是，不少民众趁着基地训练，走到基地附近拉起写有“炮火下的无奈和惊恐”“房屋龟裂无处求偿”等横幅抗议。

台军训练使当地民众愤怒，不仅因为噪音，还因生计受到影响。恒春半岛东侧的满州乡港仔村和牡丹乡旭海村都是以渔业为生，主要捕捞季节在每年3月到8月。由于火炮和导弹都朝向海面数十海里方向发射，当地鱼群收获数量大减，渔民为此数次抗议。